Эмиль Гургенович Агаджанян родился 17 июля 1966 году в Азербайджане, в городе Баку. В 1981 году окончил музыкальную школу по классу аккордеона с золотой медалью, а в 1988 — Первый Ленинградский медицинский институт.
С 1988 по 1989 работал в поликлинике №12 (Санкт-Петербург) врачом-стоматологом. В 1989 перешел в поликлинику №23, где десять лет проработал врачом-ортопедом. С 1999 занимал должность главного врача в стоматологической клинике «Астра», а с 2000 — в стоматологической клинике «Вероника».
В 2003 году создал «Клинику Доброго Стоматолога», где по настоящее время является генеральным директором.
Повышал квалификацию в Великобритании, Германии, Швеции, Италии, США, Испании, Израиле и Греции. В России в МАПО Санкт-Петербурга окончил курсы менеджмента. Автор 1 изобретения и 2 рацпредложений по методике нетрадиционного лечения тройничного нерва. Также доктор Агаджанян получил 9 патентов на стоматологический программный комплекс «МастерКлиник».
Является первым российским врачом-стоматологом, ставшим членом Европейской Ассоциации Эстетической Стоматологии. Действующий член Американской Ассоциации Косметической Стоматологии.
С 1999 года Э. Г. Агаджанян является членом общественного совета газеты «Стоматологический вестник» (Дантист), а с 2001 года — председателем Комиссии по информационной политике Стоматологической Ассоциации Санкт-Петербурга. В 2006 году Эмиль Гургенович занял должность вице-президента Ассоциации.
Эмиль Агаджанян — обладатель многих наград. Среди них медаль «Отличник стоматологии I степени», награды Стоматологической ассоциации России: «Золотой крокодил», «За вклад в дело популяризации специальности», «Лучший стоматологический сайт страны», за сайт газеты «Дантист. Стоматологический вестник», также на счету Эмиля Агаджаняна более двадцати сетевых наград за профильные сайты в Интернете.
В 1999 году вышла книга «Записки доброго стоматолога», которая переиздавалась с тех пор шесть раз и обновляется по сей день.
